Los animales, cuando la Nube salva a las especies
Charles Darwin, el más grande naturalista de todos los tiempos, en su obra «El origen del hombre y la selección sexual» escribió sobre cómo los animales son capaces de sentir y cuán similares son al hombre. «Una gran parte de las emociones más complejas -se lee- Son comunes a los animales más elevados y a nosotros. Es posible que todo el mundo haya visto cuántos celos muestra el perro si el amo prodiga su afecto a otra criatura; y he observado el mismo hecho en los monos. Esto demuestra que los animales no solo aman, sino que sienten el deseo de ser amados«.
Y es precisamente a partir de ese deseo de ser amado y de corresponder sin esperar nada que empezaremos a contarte una buena historia, para explicarte cómo el Cloud Computing puede ayudar a salvar algunas especies animales en peligro de extinción. Como el koala, por ejemplo. Un marsupial que habita en los bosques de eucaliptos australianos. Un adorable osito de peluche que, por desgracia, corre grave peligro de extinción. Clasificados como una «especie vulnerable» por WWF, estos hermosos marsupiales están cada vez más amenazados por la mano del hombre despiadado y el cambio climático.
Pero entonces, ¿cómo puede la tecnología, y la computación en la nube en particular, ponerse al servicio de estos tiernos animales? Amazon Web Services
, líder mundial en la nube, nos lo explica. Hace unos cinco años, un equipo de científicos dirigido por Rebecca Johnson, directora del Instituto de
Investigación del Museo Australiano
, comenzó a caracterizar la diversidad genética de los koalas. Pero el objetivo principal del grupo de investigadores era, sobre todo, fortalecer la capacidad de Australia para llevar a cabo proyectos de secuenciación genómica a gran escala. Entonces, después de meses y meses de estudio, el equipo publicó una investigación en
Nature Genetics
titulada «
Perspectivas de adaptación y conservación del genoma del koala
«, que identifica la base genómica de la biología única del koala.
Y aquí viene la diversión porque, como explica el evangelista jefe de AWS, Jeff Barr, crear una secuencia genética completa requiere una cantidad increíble de potencia informática y una gran cantidad de espacio de almacenamiento. Baste decir que el genoma del koala alcanza los 3.420 millones de pares de bases, un poco más grande que el genoma humano.
Los científicos, por lo tanto, utilizaron
cfnCluster
para crear múltiples clústeres. Cada uno de ellos con un número de 500 a 1000 vCPUs y con Falcon de Pacific Biosciences. En general, el equipo utilizó 3 millones de horas de núcleo de EC2, la mayoría de las cuales eran instancias de spot de Amazon EC2.
Este trabajo ha sido posible gracias a una potencia de cálculo flexible y de bajo coste que ha permitido al equipo de bioinformática experimentar con la configuración del pipeline de Falcon a medida que se optimizaba, adaptándolo a su carga de trabajo.
Una noticia casi revolucionaria, la demostración práctica de cómo la tecnología puede estar al servicio del hombre y de la naturaleza para construir un mundo mejor.
